2009.8.20更新:
建议使用BioEdit合并多个序列文件,具体请看:用BioEdit合并多个基因序列文件
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昨天做了一个小软件,把多个后缀名为.seq文件的基因序列文件合并为一个FASTA格式的文件,并且把每个.seq文件的文件名放到合并后的文件的相应基因序列的前一行。比如有两个后缀名为.seq的文件s1.seq和s2.seq,内容分别为:

GGTACCCGGGGAT……

GTCTTTCGACAGGT……

合并后的文件就是:

>s1.seq
GGTACCCGGGGAT……

>s2.seq
GTCTTTCGACAGGT……

如果合并的时候不涉及文件名,非常简单,用word就可以合并了。但要把文件名一起掺和进去,比较少见,没见过哪个软件可以这样做,所以就自己做了个小软件。

这小软件压缩之后只有4.71k,很小很简单,界面很丑…… 下载:seq文件合并小软件

关于FASTA格式:FASTA格式又称Pearson的格式,这种序列格式要求序列的标题行以大于号">"开头,之后是关于该序列的描述。下一行起为具体的序列。一般 建议每行的字符数不超过80个(也有的地方建议不超过60个)。FASTA格式的详细说明可以参考这里:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/fasta.shtml

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