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常见的DNA序列格式有下面这些：
PLAIN格式 、EMBL格式、 FASTA格式、 GCG格式、GenBank格式、 IG格式 IUPAC格式和PHYLIP格式等。这些DNA序列文件的书写规则及示例在这里有详细介绍: http://www.genomatix.de/online_help/help/sequence_formats.html
有很多软件可以对这些格式进行转换，比如SeqVerter 、DataConvert、Visual Sequence Editor 等。如果需要转换的文件不是很多，就不需要下载安装软件了，用在线工具即可：
http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/readseq/
http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/seq-util/readseq.html
这是2个可以在线进行这些格式之间的相互转换的工具，使用非常简单。
另外，如果需要将多个FASTA格式的文件合并为一个文件，这个文件合并软件可能可以用一下，不过不是太好用。
