序列分析软件ARB

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ARB是德国慕尼黑工业大学开发的一个序列分析软件包,这个软件的开发始于90年代初,距今已有十多年的历史。起初功能比较简单,主要用于rRNA序列分析,而现在ARB的功能已经非常强大,可以广泛用于核酸和蛋白质序列分析。

ARB大致有以下一些功能:

(1) 序列数据以系统发育树(phylogenetic tree)的形式在主窗口中显示,用鼠标点击可进行一系列查找及编辑操作;
(2) 序列及附属数据可以以不同格式导入和导出;
(3) 提供各种各样的算法画系统发育树;
(4) ARB有一个功能强大的编辑器,具有查找,对齐,对齐优化,二级结构检查,显示二级结构等功能;
(5) ARB的PT server提供了强大的搜索功能,可以在整个数据库中快速查找specific sequence  signatures,进行相关probe设计。

ARB最大的一个不足之处就是它是基于Unix/Linux的软件,没有Windows版本,安装使用都比较麻烦,不易上手,使不少人望而却步。刚才在谷歌中搜索了一下,竟然一篇介绍ARB的中文章都没找到。

ARB下载:

http://www.arb-home.de/downloads.html

ARB的安装:

ARB需要在Linux系统下安装,如果在windows系统中安装,需要先装一个虚拟机软件(如VMWare、Virtual PC等),虚拟一台PC,然后安装Linux系统,然后再在这个Linux系统中安装ARB。

ARB相关资料:

ARB网站:http://www.arb-home.de/
雅虎讨论组:http://tech.groups.yahoo.com/group/arb_users/
ARB Silva Database:http://www.arb-silva.de/
一篇介绍ARB的Paper:ARB: a software environment for sequence data.   Nucleic Acids Research.  2004. 32(4):1363-1371

在Origin中作切线的方法

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昨天师兄问我一个过曲线上的一点作切线的问题, 在Excel中作切线好像没有比较容易的方法,而在Origin中非常简单,只需要安装一下下面这个插件即可。

这个插件叫做 Tangent, 下载地址:Tangent

下载后双击安装,或直接拖到Origin界面中也可以安装。

安装后启动origin就会出现一个带有两个按钮的浮动窗口,点一下左边的按钮,在曲线上的选一个点然后双击,即可作出过该点的切线。

这个插件试用于Origin 7.0,7.5和8.0版本,不知道其它版本是否适用。

更多关于Origin的使用方法请参考Origin教程

可以批量调整图片大小的3个软件

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有时候需要把大量的图片调整到统一的尺寸,这就需要用到图片批量处理工具,下面是三个可以批量调整图片大小的软件:

1、JustResizeIT

JustResizeIT是一个基于Adobe AIR的批量调整图片尺寸的软件,完全免费,非常小巧,通过简单的拖曳操作即可调整图片大小,它支持PNG、JPG及GIF等多种图片格式。使用方法如下:
(1) 点“Add new”,输入调整后图片 的height和width,建立一个tool按钮;
(2) 选中所有需要调整的图片,拖到新建的tool按钮上,稍等一会;
(3) 将按钮拖到一个文件夹中,就得到了调整后的图片,也可以将按钮拖到Word中,这样所有调整后的图片就都插入到了word中。

JustResizeIT下载地址:JustResizeIT
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说说MSN密码破解

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对于一个给定的MSN帐号,要想破解密码是非常困难的,或者说一般不太可能的,如果你正在试图破解某个MSN帐号,或者正在寻找相关的破解工具,而你又不是特别精通软件和网络的高手,那么还是别折腾了,省下时间做点别的事情更好。如果随便什么人都能破解MSN密码,那谁还用MSN?

但是,在有些时候,在一些特定情况下,MSN密码又是可以破解的。
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