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一些与Kindle相关的工具和资源

叶林 — Mon, 02 Jan 2012 11:33:27 +0000

1. Kindle电子书制作及格式转换
将txt，doc，pdf等格式的资料转为适合在Kindle中阅读的电子书，一种方法可以发送到xxx@free.kindle.com，另一种方法可以使用2epub这个网站提供的在线转换工具：http://www.2epub.com/

2. 网页浏览及RSS阅读
Kindle Touch和Kindle Keyboard用来看电子书很好用，但浏览网页的时候实在是不太舒服，下面的工具可以增强Kindle的网页浏览功能。
（1）耳朵Kindle推送，将网站的RSS输出转为Kindle支持的文件格式，可以从Kindle直接下载。http://dog.whycai.com/
（2）Kinstant，有点像一个网址大全。 http://kinstant.com/

3. 免费电子书下载
（1）新浪爱问 http://ishare.iask.sina.com.cn/
（2）某位网友的dropbox分享页面：https://www.dropbox.com/s/b44t0swhzsdlaof

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香港公交车报站软件

叶林 — Sun, 30 Oct 2011 14:12:52 +0000

不知怎么回事，香港很多公交车（巴士）不报站，这让初来乍到的人非常不爽，经常坐过站或者下车一看想到的地方还没到，这严重损害了香港的城市形象。现在终于有解决办法了。

几天前，香港城巴有限公司和新世界第一巴士服務有限公司推出了一个叫做”新巴城巴“的手机软件（App），乘公交车的时候，打开这个软件，设定目的站，利用GPS功能，该软件会实时显示经过的每一个站点的名称，并且当公交车到达设定的目的站点的时候，就会发出提醒。此外，还有一些线路搜索、行程记录追踪等功能。

这个App有iPhone和Android版本，进入App Store，搜索”新巴城巴“就可以找到。

另外，九巴（九龙巴士）公司也有类似的App，名字叫KMB，不过似乎只有iPhone版本，没有Android版本。

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国产文件同步软件-快盘

叶林 — Sat, 31 Jul 2010 06:42:27 +0000

不知什么时候开始，在中国，凡是用“国产”修饰的名词，就基本意味着这是个劣质产品。现在介绍的这个快盘也不例外，它是一个模仿但远远落后于dropbox的山寨货。由于我们这个神奇的国家总是喜欢把世界上比较优秀的网站屏蔽掉，没办法，有时候也不得不用一下山寨货。

据说“快盘”有下面这些功能：

1. 实时数据备份，保障文档安全
2. 快速同步数据
3. 随时随地和你的团队分享文档
4. 移动设备直接获取资料
5. 共享文件夹，协作更高效
6. 企业微博式讨论，文档支持网页直接查看

简单试用了一下，速度还算比较快，在大陆dropbox不可用的情况下，用一下也还可以。但也有些问题：

1. 单个文件大小限制为100M，超过100M就不能同步了，而dropbox不限制文件大小；
2. 不能在Windows和Mac及Linux不同系统之间同步；
3. 虽然有ipad客户端，但没有iphone，itouch客户端，在手机上使用不方便；
4 不如dropbox简洁，软件安装时过分修改系统的设置，生成一个用处不大的盘符（K:\）就不说了，连下载保存、另存为对话框左侧的桌面图标就被替换掉了，非常不方便，而且即使将快盘的客户端软件卸载后仍然无法恢复。

这个问题可以这样解决：点开始–>运行–>输入regedit回车，依次点击
HKEY_CURRENT_USER–> Software–>Microsoft–>Windows–>CurrentVersion–>
Policies–>Comdlg32–>PlaceBar，
在其中有个K:\的哪一项上双击，将K:\改为：%USERPROFILE%\Desktop

快盘注册及下载地址为：http://k.wps.cn/
现在需要邀请才能注册，下面是两个注册码：
http://xlive.wps.cn/invite/?code=EC0993D2-579C-EE1F-3F5D-97D36A7497BC
http://xlive.wps.cn/invite/?code=195161EF-2675-83A4-E850-F49C83BD4FAE

在国外的朋友就不需要注册了，用dropbox就可以了，到目前为止，快盘几乎没有一点地方比dropbox好用。

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免费的文件备份/同步/共享工具

叶林 — Sat, 16 Jan 2010 12:28:06 +0000

有一个叫做dropbox的玩意儿，试用了一下感觉非常不错，它是一个免费的文件备份、同步、共享工具，也可以看看成是一个免费的网盘。主要功能就是能使多台电脑中的某个文件夹始终保持一致，也就是说将dropbox软件安装在多台电脑中之后，会在每台电脑中建立一个文件名为My Dropbox的文件夹，如果在其中一台电脑的这个文件夹中存放了一些文件，那么这些文件会被自动同步到其它电脑，速度超快，我用一个700多兆的文件测试了一下，瞬间完成。点击这里可以注册dropbox帐号，dropbox空间大小是2G，邀请别人注册可以增大空间，最大5G。

另外，微软也有一个类似的网站：Live mesh，空间大小5G，同步功能也很强大，但个人感觉不如dropbox简单好用。

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定时插座使用方法

叶林 — Tue, 29 Sep 2009 15:16:42 +0000

实验室有很多这种定时插座，咋看上去有点玄乎，不知道怎么用，其实很简单：
首先让箭头对准当前时间，然后按下去表示接通，扳起来表示断开。
上面是有人录制的一段视频，不错，一看就明白。

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酶切位点分析

叶林 — Sat, 26 Sep 2009 14:03:24 +0000

前段时间做了一个克隆文库，有点大，拿到上百条序列，有了序列后，想选择一种合适的酶进行酶切，进而将克隆的结果与T-RFLP的结果联系起来。试了几个软件和一些在线酶切分析工具，好像都是可以用多种酶去切一个序列，而不能同时切多个序列。要是序列不多，一个个切切还可以，可是这上百条序列就需要几百次甚至更多的重复操作，不但能把手累的抽筋，眼都能被累的抽筋，实在让人无法忍受。于是决定自己做个小工具。

首先用了几个小时速成了一下Perl语言及Bioperl，发现这玩意处理字符串真的是太方便了！只需要下面这几行代码就可以自动或半自动同时查找多个序列酶切位点了(由于T-RFLP结果只与第一个酶切位点有关，因此只找每个序列的第一个切点)。

#!/usr/bin/perl -w
use strict;
use Bio::SeqIO;
my $file = ‘All_Sequences.fas’;
my $site = ‘CCGG’;
my $n = 2;
my $inputfile = Bio::SeqIO->new(-format => ‘fasta’, -file => $file);
my $outputfile = “Result.txt”;
unless ( open(RESULT, “>$outputfile”) ) {
print “Cannot open \”$outputfile\” to write to!!\n\n”;
exit;
}
while ( my $seq = $inputfile->next_seq) {
my $str = $seq->seq;
if ( $str =~ /$site/ ) {
print RESULT index ($str, $site, 0)+$n, “\n”;
print $seq->id, ” -> “, index ($str, $site, 0)+$n,”\n”;
}
}
close(RESULT);

使用说明：

首先要先安装Perl，另外还需要安装Bioperl。然后将上面这段代码保存到一个文本文档中，将后缀名改为.pl，把待切的多条序列合并到一起(fasta格式)，命名为All_Sequences.fas，和这个.pl文件放在同一个文件夹，然后和运行其它perl程序一样运行就可以了。需要说明的是上面只是用一个酶(MSP I)去切放在All_Sequences.fas这个文件中的所有序列，结果保存打印在屏幕上同时保存在Result.txt这个文件中，如果需要用别的酶，my $site = ‘CCGG’;和my $n = 2;这两行需要进行相应的修改，具体怎么改我就不说了，做酶切的同学肯定知道怎么改。

显而易见，这个东西使用起来不是很方便，因此如果需要处理的序列不是很多，使用这个代码没有什么优势，不需要使用，序列多的话，可以考虑用一下。

有人知道用什么软件可以进行类似的操作吗？如果知道，麻烦留言告诉我一下:)

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