有个博客 » 美国 http://www.yelinsky.com/blog Fri, 03 Feb 2012 11:34:02 +0000 en hourly 1 http://wordpress.org/?v=3.3.1 Google涉足DNA数据库领域 http://www.yelinsky.com/blog/archives/387.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/387.html#comments Fri, 14 Oct 2011 02:17:11 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/?p=387 随着高通量测序的发展，海量的数据源源不断的产生，以至于美国国家生物技术信息中心（NCBI）都受不了了，由于经费不足，于2011年2月关闭了Sequence Read Archive（SRA）数据库，停止接受用户提交的下一代测序数据。

据报道，近日，Google和TPG Biotech联合投资1500万美元致力于打造DNA云数据库，Google将和DNAnexus一起接管NCBI的海量数据库，继续为科研人员提供免费的DNA数据信息。

把云存储、云计算和DNA数据库结合起来，这是一个有着无限前景的领域，相信Google强大的技术一定能在这个领域有所作为。

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/387.html/feed 2 走马观花美国行 http://www.yelinsky.com/blog/archives/385.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/385.html#comments Wed, 05 Oct 2011 19:25:33 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/?p=385 几天时间内从美国西部飞到东部，然后又从飞回来西部，San Francisco, Phoenix, St. Louis, Charlotte, Knoxville, Philadephia, San Francisco….. 折腾啊……

期间遇到不少在美国工作和读书的中国人，感觉他们的生活基本上是有滋有味的，虽然并不是很富有，但很舒坦。谈吐间似乎总是流露着某些自豪感。相比之下，在中国大陆和朋友聊天的时候，总是听到很多抱怨，对制度的各种无奈，对现状的各种不满……


傍晚，Walnut Creek的一条路，行人很少，只有呼啸而过的汽车。


Walnut Creek是美国能源部联合基因研究所（DOE JGI）所在地。


JGI一角，环境挺不错的。


Walnut Creek的一个公园。


圣路易斯拱门，美国西部开发的象征。


林肯大学


苏里州议会大厦，位于杰斐逊市，美国很多地方把政府所在地设在小城市，据说是为了减少办公成本。


苏里州议会大厦旁边的密苏里河，是密西西比和两大支流之一，另一支流是俄亥俄河。记得小学、初中上地理课，总是被逼着念叨这些玩意儿。


田纳西大学


旧金山市区的有轨电车，地上的圆盘，是用来转换方向的，完全手动操作，蛮好玩的。

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/385.html/feed 3 在美国看医生 http://www.yelinsky.com/blog/archives/384.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/384.html#comments Wed, 05 Oct 2011 04:20:40 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/?p=384 真是没想到，第一次来美国就去看了个医生。

第一天来的时候感觉脖子上长了个像痘痘一样的东西, 没怎么在意，结果这家伙竟然越长越大，越来越疼，疼的晚上没法睡觉。想去药店买点消炎药什么的根本买不到，美国对抗生素类的药品管理很严，没有医生的处方不能买。药店工作人员推荐我去一个叫urgent care的地方看医生。

看了医生后，做了个小小的手术，由于没有保险，需要完全自费，166美元。另外医生还给开了一个抗生素的处方，40片盘尼西林，去药店买，6美元。整个过程中遇到的医生和护士态度都很友好。护士都是老外，医生长着一副典型的中国面孔，可是他呱啦呱啦一直和我说英文，我跟他来了句中文，竟然不搭理我，一问才知道原来是个韩国人。。。。

对比一下这次在美国看医生和以前在中国看医生的经历，感觉有蛮多不太一样的地方：
1. 没有排队挂号、排队划价、排队拿药这些折腾人的过程，也没有专家号、非专家号之类的东西，但看医生前得电话预约。
2. 不一定要治病之前付费，可以在完成治疗之后再付钱，我就是这样，离开医院的时候才付的款。另外在付费的时候检查加手术总共166美元。我给了200，结果找了半天零钱还是找不开，工作人员说，要不这样吧，先收你一百，等你回家之后再把剩下的付给我们。为了避免回去之后付款麻烦，我用信用卡付了款。在中国看病，好像不见钱一般是不会给治的吧。
3. 对药品，尤其是抗生素类的药品，管理非常严格。医院不卖药，看完医生之后凭医生的处方，去专门的药店买。
4. 有保险的人（美国人和长期居住在美国的人都得购买保险），看病费用很低甚至免费，没有保险，就比较贵。

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/384.html/feed 3 Hello San Francisco http://www.yelinsky.com/blog/archives/383.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/383.html#comments Tue, 04 Oct 2011 01:32:42 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/?p=383 第一次来美国，感觉还是蛮新奇的。

入境的时候，朋友告诉我，工作人员在检查签证时会问些问题，为了避免由于英语不太流利造成麻烦，我特意提前准备了一下可能被问到的问题。结果没想到，给我检查签证的是位非常Nice的香港人（应该已经加入美国国籍），直接用带着浓厚港味的普通话问我：“你来美国干什么啊？你是山东人啊？怎么在香港呢？”然后就blabla…开始用普通话聊起来了，就在检查和盖章的短短几分钟之内，聊到了中国的中国的腐败问题，中国的环境污染问题，去清华大学和香港大学读书哪个更好的问题。。。。就这些问题不太深入地交换了看法，非常愉快地结束了面谈。

前几天忙里偷闲去旧金山转了一圈，基本有两个感觉：1. 美国的确是个各个方面都很不错的国家，虽然最近经济不太好；2. 中国人非常多，随处可见。


金门大桥，建于70多年前，雾实在太大，看不见顶。这里有清晰的图片。


很多人在大桥上健走，庆祝中华民国建国百年。那个婴儿车上的国旗有点拉风。


渔人码头供人参观的潜艇和军舰，远处的小岛据说以前是监狱，还据说岛上的囚犯曾经挖地道，泅海越狱，至今下落不明。


一地海鸥、海鸥屎、鸽子、鸽子粪。


一大堆各式游艇


海鲜大排档


主要是卖螃蟹，个头很大


离渔人码头不远的唐人街，好像大部分人都讲广东话。

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/383.html/feed 9 年薪30万 http://www.yelinsky.com/blog/archives/371.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/371.html#comments Fri, 24 Jun 2011 15:07:22 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/archives/371.html 目前，生活在中国的城市里，年收入少于20～30万(RMB)这个范围，基本很难过上体面的生活。

据我了解，学生物、化学及其相关专业的同学，无论是本科、硕士还是博士，大部分人毕业后相当长一段时间内，只有在做梦的时候才能达到这个收入水平。

但是也有个别例外的情况，下面就是一个，给拥有博士学位且年收入低于30万的朋友参考一下：

一个朋友的朋友，环境工程专业，在国内读完本科和硕士之后，去美国中等偏上一点的一个学校读了个博士，并做了一年博后，然后又在美国一个公司工作了一年。今年打算回国，深圳一公司答应给他年薪30万人民币，结果他不太满意，他的目标是36万……

正在迷茫着、愁着毕业后赚不到钱的本科或硕士即将毕业的同学，不妨学学上面这位大哥。

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/371.html/feed 6 高通量测序仪世界分布图 http://www.yelinsky.com/blog/archives/356.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/356.html#comments Sun, 27 Mar 2011 14:21:49 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/archives/356.html 想知道世界上哪些单位有高通量测序仪吗？剑桥大学的James Hadfield利用Google地图API制作了一个高通量测序仪分世界布图，这个地图非常直观地展示了高通量测序仪的数量及在各个国家和地区的分布情况。要是再把其中提供商业服务的单位的高通量测序报价也标上去，就更好了。

网址：http://pathogenomics.bham.ac.uk/hts/

另外，这里还有一些具体的统计数据：http://pathogenomics.bham.ac.uk/hts/stats

之前一直以为华大一下子买了150多台，中国高通量测序仪肯定挺多的，没想到，还是不到美国的三分之一。到目前为止，美国的635台高通量测序仪是分布于194个机构，而中国内地的183台仅分布于7个机构，这7个机构分别是：华大（156台），浙江大学（1台），苏州生物医药创新中心（1台），上海康成生物（1台），上海生物芯片有限公司（7台），北京贝瑞和康生物技术有限公司（2台），中科院北京基因研究所（15台）。与美国相比，分布过于集中，不是太好。

中国台湾有21台，中国香港有13台。

在这些高通量测序仪中，Illumina Genome Analyser 2x和Illumina HiSeq 2000占了大多数，而ABI SOLiD和Roche 454相对较少。

值得注意的是，俄罗斯说：”你们玩吧，哥不和你们凑这个热闹了“。俄罗斯竟然只有八台，与马来西亚拥有的数目相同。这是怎么回事呢？

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/356.html/feed 2 两个高通量测序方面的培训班 http://www.yelinsky.com/blog/archives/353.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/353.html#comments Thu, 10 Mar 2011 14:24:45 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/archives/353.html 目前在很多与生物相关的领域，高通量测序的应用都在急剧、爆炸式地增加，可是高通量测序数据处理对很多生物专业的人来说并不是件很容易的事情，于是就有必然会有培训班……下面是最近看到的两个高通量测序相关的培训班：

一个是由美国能源部（The U.S. Department of Energy, DOE）联合基因研究所（Joint Genome Institute, JGI）举办的Microbial Genomics & Metagenomics Workshops
地点：Walnut Creek, California
时间：5天（在2011年每隔几个月举行一次）
费用：250美元（约等于1600人民币）
网址：http://www.jgi.doe.gov/meetings/mgm/

另一个是由华大基因举办的生物信息学前沿技术专题培训班
地点：深圳
时间：5天（2011年03月28日至2011年04月1日）
费用：6800元人民币
网址：http://www.genomics.cn/edu.php?id=398

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/353.html/feed 0 美国总统奥巴马获胜演讲视频 http://www.yelinsky.com/blog/archives/114.html http://www.yelinsky.com/blog/archives/114.html#comments Thu, 06 Nov 2008 09:29:07 +0000 叶林 http://www.yelinsky.com/blog/?p=114 昨天，奥巴马当选为下一届美国总统，成为美国第一位黑人总统。下面是奥巴马获胜演讲视频，拿来当作听力练习材料蛮不错:)
新浪上说，一位接近他的人士介绍，“他过去讲英语并没有任何口音，但现在演讲中你可以明显感觉到，他有意带了一点黑人的口音”，你们能听出来吗？

美国总统奥巴马竞选获胜演说，美国时间2008年11月4日，美国芝加哥。

这里有奥巴马竞选获胜演说的演讲稿（中英文对照）

这里可以边看视频边看演讲稿

如转载，请以超链接形式注明：转载自：有个博客 [ http://www.yelinsky.com/blog/ ]

相关日志

]]> http://www.yelinsky.com/blog/archives/114.html/feed 2