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问题是这样的:有很多很多序列,几百条,想大致了解一下这些序列分别是什么样的微生物,如果一条一条去blast,那是相当的累。想找一个工具告诉我每条序列blast结果的前几条的名称是什么即可,不需要其它信息。
在网上找了一下,没找到合适的软件或工具,虽然有些关于批量blast的教程之类的,比如这个,但是给出的结果及其繁琐,很多不需要的信息。
后来发现Biopython可以很简单就进行批量Blast。只需先安装Python和Biopython,Python和Biopython的下载地址分别为:
http://www.python.org/download/
http://www.biopython.org/wiki/Download