T-RFLP操作步骤

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T-RFLP (Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism) 和DGGE类似,也是一种可以用于分析微生物群落结构的DNA Fingerprinting方法。与DGGE相比它重复性更好,定量更准确,实验流程也比DGGE的操作步骤简单很多,而且不像DGGE那样,要进行很多次反复的优化才能得到比较好的结果。但是T-RFLP的成本要比DGGE高一些,主要因为T-RFLP最后一步要用测序仪完成。下面是T-RFLP的简要操作流程:
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PCR-DGGE操作步骤

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变性梯度凝胶电泳(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis, PCR-DGGE)和FISH一样,也是一个常用的分子生物学实验,在环境生物技术领域常用于分析微生物群落的多样性。DGGE实验的大体操作流程如下,比较麻烦,影响因素很多,有一段时间我曾经天天捣鼓PCR-DGGE,反复优化各个条件,非常无聊。
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荧光原位杂交(FISH)实验操作步骤

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荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization,FISH)是一个很重要的生物学实验技术,它的特点是原位,无需经过PCR,可以用于对环境样品中特定的微生物进行定量分析。下面是以活性污泥为例的FISH实验步骤及方法。非生物学专业的同学请不要往下看了。
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Google Books图书搜索阅读下载工具

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Google books 对于喜欢看书的人来说真是个不错的东西,里面可以找到很多各种各样的免费图书杂志,可是Google Books只能在浏览器里看,给人的感觉不太好,还有一点就是图书不能下载到自己电脑里保存,只可以在线阅读。
Gooreader是一个搜索阅读下载Google Books里面图书的软件,可以通过它直接在Google Books里面搜索图书杂志,搜到的书整齐地显示在书架上,界面非常漂亮:
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香港读书 – 内地签注延期办理流程

杂七杂八 No Comments »

香港学生签注(签证)延期分为大陆签注延期香港签注延期,办理签注延期要先办理香港签注延期,香港签注延期办理方法请看:这里。必须先办好香港签注延期才可以办理大陆签注延期。

大陆签注延期可以在香港由中国旅行社代办,也可以回户口所在的公安局办理,下面是由中旅代办的办理流程:

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Matlab计算图片上不同颜色区域的面积

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几个月前帮一个同学弄了个简单的计算图片上的白点区域占图片中面积百分比的matlab小程序。几天前他告诉我还想用一下,可是不知道保存到哪里去了,找不到了,弄丢了,让我帮他找找,我还是放在博客上吧,这下丢不了了。

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立体快巴

杂七杂八 No Comments »

现在越来越多的人被塞进了城市,交通堵塞是必然的,让为了解决这问题,人们真是绞尽脑汁啊!限行、错峰,单双号……最近有人想出了这么一招,让公交车骑在路上跑–立体快巴。这创意看起来还真不错:
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国产文件同步软件-快盘

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不知什么时候开始,在中国,凡是用“国产”修饰的名词,就基本意味着这是个劣质产品。现在介绍的这个快盘也不例外,它是一个模仿但远远落后于dropbox的山寨货。由于我们这个神奇的国家总是喜欢把世界上比较优秀的网站屏蔽掉,没办法,有时候也不得不用一下山寨货。
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批量Blast小程序

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问题是这样的:有很多很多序列,几百条,想大致了解一下这些序列分别是什么样的微生物,如果一条一条去blast,那是相当的累。想找一个工具告诉我每条序列blast结果的前几条的名称是什么即可,不需要其它信息。

在网上找了一下,没找到合适的软件或工具,虽然有些关于批量blast的教程之类的,比如这个,但是给出的结果及其繁琐,很多不需要的信息。

后来发现Biopython可以很简单就进行批量Blast。只需先安装PythonBiopython,Python和Biopython的下载地址分别为:
http://www.python.org/download/
http://www.biopython.org/wiki/Download

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欧洲之行的一点小事

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在欧洲的时候和一个老外聊天聊到中国人旅游习惯和他们的不太一样,他们喜欢在一个地方住上十天、半个月,而中国人旅游喜欢在一个城市住一、两天后马上赶到下一个地方,过一、两天后再赶到下下个地方……不停地赶路……我说,这很简单的道理呀!中国人收入低啊!有钱的话,傻瓜才这样折腾自己呢。在中国普通工人要工作1-2年,省吃俭用,省下的钱才可以去欧洲旅游2周,出来一趟不容易,想多看些东西,自然会形成这种习惯。这时我旁边的两个同学立即对我的说法表示反对,说中国人没这么穷,事实上呢,中国人的确是这么穷:
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