拷贝数(Copy Number)计算器

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做qRT-PCR的时候经常需要计算DNA拷贝数(Copy Number),比较烦,用下面这个计算器就方便多了!

DNA量 (ng):

长度 (bp):

拷贝数(Copy Number): x10^

说明:
1 上面的计算器中假设1mol base pair(bp)的质量是660g
2 使用的公式是Copy Number = ( amount * 6.022x10^23) / (length * 1x10^9 * 660)
3 其中的Javascript函数是从这里复制的,将其中的650改为了660。

什么是拷贝数?看这里:http://baike.baidu.com/view/1321865.htm
如何计算拷贝数?计算方法:(6.02 x 10的23次拷贝数/摩尔) x (浓度g/ml) / (MW g/mol) = copies/ml [平均分子量: dsDNA=(碱基数) x (660 道尔顿/碱基) ssDNA=(碱基数) x (330 道尔顿/碱基) ssRNA=(碱基数) x (340 道尔顿/碱基)]

Wordpress数据库导入出错的解决方法

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Wordpress博客从一个主机空间搬到另一个空间的时候,由于不同空间服务商提供的mysql数据库版本可能不同,在原来空间的MyPhpAdmin导出的时候没有问题,但在另一个空间的MyPhpAdmin导入到时候就会出现各种各样的问题,比如:

#1062 - Duplicate entry '2' for key 1
Duplicate entry ‘%s’ for key %d 错误编号:1062

如果对mysql数据库不是很熟悉,遇到这样的问题就比较麻烦。

其实,这种由于mysql数据库版本不同导致的Wordpress数据库导入出错可以这样解决:

导出数据库的时候不用MyPhpAdmin,而用Wordpress备份插件WordPress Database Backup备份数据库,将备份文件导入,这样就不会出错了。

两个Wordpress备份插件

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现在越来越多的人开始选择用wordpress搭建自己的博客,博客建立后,为了防止主机故障或其它原因造成博客上文章丢失,应该定期进行备份,下面是两个wordpress备份插件:

(1) WordPress Database Backup
这是一个Wordpress数据库备份插件,很好用,可以定期将wordpress数据库备份到网站空间,也可以将备份文件发到某个邮箱。这个插件除了可以备份数据库,还可以用于解决wordpress数据库导入出错的问题

下载地址:WordPress Database Backup

安装方法和其它wordpress插件一样,安装并启用后,在Tools → Backup下面进行备份。

(2) BackUpWordPress
上面的插件只能备份数据库,而BackUpWordPress这个插件既可以备份数据库,又可以备份网站上的文件,备份的内容都可以发到指定的Email地址,功能非常强大。

下载地址:BackUpWordPress

在Origin中作切线的方法

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昨天师兄问我一个过曲线上的一点作切线的问题, 在Excel中作切线好像没有比较容易的方法,而在Origin中非常简单,只需要安装一下下面这个插件即可。

这个插件叫做 Tangent, 下载地址:Tangent

下载后双击安装,或直接拖到Origin界面中也可以安装。

安装后启动origin就会出现一个带有两个按钮的浮动窗口,点一下左边的按钮,在曲线上的选一个点然后双击,即可作出过该点的切线。

这个插件试用于Origin 7.0,7.5和8.0版本,不知道其它版本是否适用。

更多关于Origin的使用方法请参考Origin教程

猪流感疫情地图

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这几天猪流感搞得人心惶惶,据说连奥巴马牵扯进去了。世界卫生组织25日宣布,在美国和墨西哥暴发的人感染猪流感疫情构成“具有国际影响的公共卫生紧急事态”。看来有点严重……

目前世界卫生组织已经通过Google地图制作了世界各地猪流感疫情地图,将各地区病情情况进行了标注,其中紫色标准的地方确定有人感染H1N1型猪流感,粉红色标注的地方有疑似病例,黄色标注地方有可能会爆发疫情。准备到国外出差或旅游的朋友要多加注意了!

View H1N1 Swine Flu in a larger map

以下是猪流感相关资料(来源于网络):

什么是猪流感:
猪流感全称猪流行性感冒,是猪的一种急性、传染性呼吸器官疾病。其特征为突发,咳嗽,呼吸困难,发热及迅速转归。猪流感是猪体内因病毒引起的呼吸系统疾病。猪流感由A型流感引发,通常爆发于猪之间,传染性很高但通常不会引发死亡。秋冬季属高发期,但全年可传播。猪流感是一种由A型猪流感病毒引起的猪呼吸系统疾病,该病毒可在猪群中造成流感暴发。通常情况下人类很少感染猪流感病毒。更多关于猪流感的介绍>>>

猪流感症状:
人感染猪流感后的症状与感冒类似,患者会出现发烧、咳嗽、疲劳、食欲不振等。此次猪流感美国发现病例的主要表现为突然发热、咳嗽、肌肉痛和疲倦,其中一些患者还出现腹泻和呕吐症状;墨西哥发现病例还出现眼睛发红、头痛和流涕等症状。

如何预防猪流感:
在预防方面,现阶段没必要扎堆去接种人流感疫苗,因为预防季节性流感疫苗对预防猪流感并无效果。正确的做法是养成良好的个人卫生习惯,充足睡眠、勤于锻炼、减少压力、足够营养;勤洗手,尤其是接触过公共物品后要先洗手再触摸自己的眼睛、鼻子和嘴巴;打喷嚏和咳嗽的时候应该用纸巾捂住口鼻;室内保持通风等。

Picasa相册图片不显示的原因

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下面的内容是关于Picasa相册外链不显示的原因及解决办法,如果你是在自己电脑上无法看Picasa相册图片,并且你在中国大陆,那么可能是Picasa相册被封了。解决办法请看:Google Picasa相册图片不显示的解决办法

Google的Picasa Web Albums是非常优秀的网络相册,免费并且支持外链。最近遇到一个问题,将图片上传到Picasa网络相册后,在图片上点右键,复制图片地址,插入到博客日志中,无论如何都不显示,而将图片地址粘贴到地址栏中却可以正常显示。琢磨了一下,原来是这么回事:

在图片上点右键属性,复制地址,得到的地址是下面的形式:
http://lh4.ggpht.com/_wNd_3xLLEJQ/SfMvVjM6g2I/AAAAAAAAACc/mLQP44um_qU/1.jpg

上面这个地址不能直接引用,必须改成下面这样的才可以:
http://lh4.ggpht.com/_wNd_3xLLEJQ/SfMvVjM6g2I/AAAAAAAAACc/mLQP44um_qU/s800/1.jpg

其中的s8oo可已替换为s32、s48、s64、s72、s94、s110、s144、s128、s160、s200、s220、s288、 s320、s400、s512、s800、s1024、s1440、s1600,替换后显示相应宽度的缩略图。最大只能显示图片的原始大小,图片不会被放大。

常见的DNA序列格式及相互转换软件

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常见的DNA序列格式有下面这些:

PLAIN格式 、EMBL格式、 FASTA格式、 GCG格式、GenBank格式、 IG格式 IUPAC格式和PHYLIP格式等。这些DNA序列文件的书写规则及示例在这里有详细介绍: http://www.genomatix.de/online_help/help/sequence_formats.html

有很多软件可以对这些格式进行转换,比如SeqVerter 、DataConvert、Visual Sequence Editor 等。如果需要转换的文件不是很多,就不需要下载安装软件了,用在线工具即可:
http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/readseq/

http://searchlauncher.bcm.tmc.edu/seq-util/readseq.html
这是2个可以在线进行这些格式之间的相互转换的工具,使用非常简单。

另外,如果需要将多个FASTA格式的文件合并为一个文件,这个文件合并软件可能可以用一下,不过不是太好用。

可以批量调整图片大小的3个软件

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有时候需要把大量的图片调整到统一的尺寸,这就需要用到图片批量处理工具,下面是三个可以批量调整图片大小的软件:

1、JustResizeIT

JustResizeIT是一个基于Adobe AIR的批量调整图片尺寸的软件,完全免费,非常小巧,通过简单的拖曳操作即可调整图片大小,它支持PNG、JPG及GIF等多种图片格式。使用方法如下:
(1) 点“Add new”,输入调整后图片 的height和width,建立一个tool按钮;
(2) 选中所有需要调整的图片,拖到新建的tool按钮上,稍等一会;
(3) 将按钮拖到一个文件夹中,就得到了调整后的图片,也可以将按钮拖到Word中,这样所有调整后的图片就都插入到了word中。

JustResizeIT下载地址:JustResizeIT
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用Gmail代替Foxmail/Outlook收发邮件

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很多人喜欢用Foxmail/Outlook收发邮件,但是有时候会有这样的问题:有的公司或学校提供的邮箱比较小(只有一百或几百M),就需要在Foxmail/Outlook中设置收邮件时删除邮件的服务器备份(否则邮箱很快就满了),这样设置了以后,邮件就下载下来保存在了电脑中,当在使用另一台电脑时,想看一下以前某一封的邮件,就干瞪眼了……

用Gmail代替Foxmail/Outlook收发邮件就可以解决这个问题,这里所说的不是放弃原来的Email地址使用Gmail的,而是仍然用原来的Email地址,只不过是用Gmail进行收发邮件。

首先需要有一个Gmail帐号,没有的话,在这里注册。登录后,点击的“设置”-“账户”,在“添加您拥有的其他电子邮件地址”中填入Email地址进行确认,然后在“添加您拥有的邮件帐户”中设置收邮件的相关信息,与Foxmail/Outlook的设置方法基本一样。

这样收到的Email就都被下载到Gmail中保存了,随时随地,只要能上网,就可以看以前任何时候的邮件。在自己的电脑上,即使不能上网,也可以看以前的邮件,因为Gmail现在有离线功能(需要在“设置”-“实验室”中启用)。发邮件到时候,选择自己的Email地址作为发件人,在别人看来,根本看不出是从Gmail中发出的邮件。

使用Gmail Notifier在有新的Email时,可以即时收到提示。如果你使用Firefox浏览器,可以安装Gmail Notifier Firefox 插件,这个也蛮好用的。

中国远征军视频集

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前几天看了一部凤凰卫视制作的纪录片《中国远征军》,感慨万千!
该片共分十集,2005年8月在凤凰大视野节目中播出,下面是新浪播客上的视频链接:

1 挥师缅甸 http://you.video.sina.com.cn/b/11360326-1250183650.html
2 同古之战 http://you.video.sina.com.cn/b/11385814-1250183650.html
3 仁安羌大捷 http://you.video.sina.com.cn/b/11392942-1250183650.html
4 滇北大溃退 http://you.video.sina.com.cn/b/11403889-1250183650.html
5 兵败野人山 http://you.video.sina.com.cn/b/11404958-1250183650.html
6 空中生命线 http://you.video.sina.com.cn/b/11512792-1250183650.html
7 缅北大反攻 http://you.video.sina.com.cn/b/11936398-1250183650.html
8 光复腾冲 http://you.video.sina.com.cn/b/11938843-1250183650.html
9 松山血战 http://you.video.sina.com.cn/b/11939407-1250183650.html
10 胜利会师 http://you.video.sina.com.cn/b/11945289-1250183650.html

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